农业部土壤微生物重点实验室依托于中国农业大学微生物学专业，现有固定人员29名，其中教授11人，副教授11人；客座人员5人，在读研究生199人。在人才和科研团队建设方面已经形成了以李季伦、陈文新两位院士为学科带头人、中青年骨干占优势的教师队伍，梯队结构合理。科研队伍中有中科院院士2名，国家杰出青年科学基金获得者1人，入选“教育部新（跨）世纪优秀人才支持计划”1人，主要学科带头人11人。