依托农业部东北区域农业微生物科学观测实验站建立的内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室于2003年11月27日教育部批准立项建设（教技函[2003]56号）。2005年11月26日通过了教育部组织的专家验收。“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室下设1个中试车间和3个研究室，总面积为3500 平方米的实验室和1200平方米的中试车间，具有四极杆-飞行时间串联液质联用仪、RT-PCR仪、梯度基因扩增仪、凝胶成像分析系统、DGGE电泳仪、蛋白质双向电泳仪、高效液相色谱仪、气相色谱仪、低温层析分离系统、全自动发酵罐、真空冷冻干燥机、大容量高速冷冻离心机、紫外可见分光光度计等总价值3500万元的仪器设备，达到了国内较为先进的研究条件。